Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00862A6NCI5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00862A6NCI5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00862A6NCI5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms