Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MAP1LC3B2A6NCE7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms