Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCHNA4D1U4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LCHNA4D1U4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCHNA4D1U4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCHNA4D1U4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms