Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPED1A4D0V7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPED1A4D0V7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms