Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF27A3QJZ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF27A3QJZ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms