Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087X1B8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087X1B8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms