Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAV27A0A087WT01 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV27A0A087WT01 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms