Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms