Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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