Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms