Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL42Q9P2K6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms