Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC88CQ9P219 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms