Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms