Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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