Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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GDE1Q9NZC3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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