Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIS18AQ9NYP9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms