Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN6Q9NWW5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms