Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCM2LQ9NUG4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms