Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EMILIN3Q9NT22 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms