Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLIRPQ9GZT3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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