Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms