Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms