Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms