Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARD11Q9BXL7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms