Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2AFJQ9BTM1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms