Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BPIFA3Q9BQP9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms