Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms