Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIN3AQ96ST3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms