Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL7Q96S82 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms