Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAX2Q96IS3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms