Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCMH1Q96GD3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms