Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMARCE1Q969G3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms