Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC9Q92623 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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