Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms