Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC12Q8WUD4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms