Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE22Q8NFJ8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms