Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF148Q8N7C7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms