Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LNX2Q8N448 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms