Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME9Q86XW9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms