Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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