Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH9

PAMR1, Inactive serine protease PAMR1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAMR1Q6UXH9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAMR1Q6UXH9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms