Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMBR1LQ6UX01 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMBR1LQ6UX01 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms