Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms