Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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