Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms