Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD40Q6AI12 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms