Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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