Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms