Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF1Q3BBV0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms