Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PROX2Q3B8N5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms